Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmod1P49813 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmod1P49813 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms