Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CitP49025 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CitP49025 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CitP49025 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CitP49025 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms