Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ptx3P48759 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms