Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rfx1P48377 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.6 ms