Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rplp1P47955 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms