Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ItgavP43406 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ItgavP43406 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms