Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx1-2P42580 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nkx1-2P42580 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms