Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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VhlP40338 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
VhlP40338 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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VhlP40338 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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VhlP40338 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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