Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lig1P37913 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lig1P37913 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms