Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rab20P35295 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Rab20P35295 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rab20P35295 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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