Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cd28P31041 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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