Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprmP28828 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprmP28828 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprmP28828 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PtprmP28828 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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