Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
RxraP28700 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
RxraP28700 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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