Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
BgnP28653 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
BgnP28653 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BgnP28653 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
BgnP28653 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BgnP28653 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BgnP28653 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BgnP28653 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BgnP28653 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
BgnP28653 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
BgnP28653 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms