Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Dusp1P28563 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms