Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

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Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Hoxd12P23812 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms