Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxb9P20615 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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