Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Pou5f1P20263 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pou5f1P20263 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms