Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P18530 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P18530 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18530 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18530 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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