Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtpraP18052 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PtpraP18052 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PtpraP18052 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PtpraP18052 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms