Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Calb1P12658 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms