Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04213 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
P04213 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
P04213 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
P04213 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms