Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
P04212 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P04212 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P04212 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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