Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifnb1P01575 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifnb1P01575 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms