Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CcnkO88874 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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CcnkO88874 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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CcnkO88874 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CcnkO88874 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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