Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
E2f6O54917 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms