Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Opn1mwO35599 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Opn1mwO35599 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Opn1mwO35599 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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