Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dctn1O08788 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms