Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sec22bO08547 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sec22bO08547 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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