Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm5849J3QPE5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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