Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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