Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc180J3QNE4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc180J3QNE4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms