Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21244J3QK38 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm21244J3QK38 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Gm21244J3QK38 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21244J3QK38 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm21244J3QK38 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm21244J3QK38 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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