Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gm21411J3KMS0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gm21411J3KMS0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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