Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms