Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NpcdF8VQB8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NpcdF8VQB8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms