Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LctF8VPT3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms