Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm28048F7BCN0 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm28048F7BCN0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm28048F7BCN0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Gm28048F7BCN0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm28048F7BCN0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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