Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zkscan1-203ENSMUST00000110962 4843 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem144-202ENSMUST00000168038 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm4880-201ENSMUST00000207645 1696 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43795-201ENSMUST00000202051 2366 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm12436-201ENSMUST00000131099 2959 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC122197.1-201ENSMUST00000220281 2142 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pan2-201ENSMUST00000005825 4445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ptch1-202ENSMUST00000192155 7002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 C6-203ENSMUST00000162350 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc12a4-202ENSMUST00000116429 3755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mylk3-201ENSMUST00000034133 3696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms