Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms