Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Susd1E9Q3H4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Susd1E9Q3H4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Susd1E9Q3H4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Susd1E9Q3H4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Susd1E9Q3H4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Susd1E9Q3H4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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