Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Syde2E9PUP1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Syde2E9PUP1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms