Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms