Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc6D3YZP9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc6D3YZP9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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