Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BC048679D3YXE9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BC048679D3YXE9 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms