Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp42B2RQC2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms