Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Trabd2bB1ATG9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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