Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttll13A4Q9F6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttll13A4Q9F6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms