Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Lcn6A2AJB9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lcn6A2AJB9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms