Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn34dA2AGU5 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms